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基于基元模式分析的代谢网络调控机制研究文献综述

 2020-06-30 09:06  

构建希瓦氏菌代谢网络模型并结合文献数据分析代谢调控规律 NETWORK ANALYSIS MODEL AND METABOLIC REGULATIONS OF Shewanella oneidensis MR-1 ILLUSTRATED BY DOCUMENTARY DATA 选题目的 菌株性质与应用 希瓦氏菌(Shewanella oneidensis MR-1,下文均简称son)是革兰氏阴性的兼性好氧菌1。

希瓦氏菌因为其多样的呼吸能力,错综复杂的电子传输能力,使其成为在生物修复(bioremediation)领域的一个重要模型。

其中呼吸作用很多样,在有氧条件下可以直接利用氧气作为最终的电子受体;而在无氧条件下,便可以利用多种电子受体如一些金属离子Mn(Ⅲ,Ⅳ),Fe(Ⅲ),Cr(Ⅵ),U(Ⅵ)作为电子受体从而进行无氧呼吸,这种无氧呼吸条件下电子受体的多样性这一特征仅在希瓦氏菌中有体现。

根据其上无氧呼吸的特点,即可以自动还原金属离子的生物特性理所当然地在环境污染治理方面被广泛研究。

此类细菌可以在溶液中将离子形态的铀和铬直接降解为固体形式从而分离。

另外,希瓦氏菌可以利用S0或者硫代物去产生大量的硫化物,进而硫化物再与金属离子结合生成难溶化合物而脱离体系。

最后,这类菌还可以应用于无氧环境中的生物修复:可以利用其去特性处理被污染环境中的铁和锰离子。

以上可看出son菌株在厌氧环境下对金属和生物污染物都有直接的生物修复作用。

根据son以上的特点,所以如何深入了解希瓦氏菌,如何掌握其特殊性质的规律以及利用此特性经行改造放大成为了一个很有意义的题目。

该细菌在database KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)中找到相关信息与所有代谢网络(图一)。

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