1. 研究目的与意义（文献综述包含参考文献）

构建希瓦氏菌代谢网络模型并结合文献数据分析代谢调控规律 network analysis model and metabolic regulations of shewanella oneidensis mr-1 illustrated by documentary data 选题目的 菌株性质与应用 希瓦氏菌(shewanella oneidensis mr-1,下文均简称son)是革兰氏阴性的兼性好氧菌1。

希瓦氏菌因为其多样的呼吸能力，错综复杂的电子传输能力，使其成为在生物修复(bioremediation)领域的一个重要模型。

其中呼吸作用很多样，在有氧条件下可以直接利用氧气作为最终的电子受体；而在无氧条件下，便可以利用多种电子受体如一些金属离子mn(Ⅲ，Ⅳ)，fe(Ⅲ),cr(Ⅵ),u(Ⅵ)作为电子受体从而进行无氧呼吸，这种无氧呼吸条件下电子受体的多样性这一特征仅在希瓦氏菌中有体现。

2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

算法与软件 因为基元模式的数量靠普通的分析是很难完成的，需要借助计算机(in silico)等做出分析和预测6。

本文将借助matlab与其平台上的专门分析基元模式的应用cellnetanalysis7进行分析和结果的讨论。

希瓦氏菌的现有文献分析 xueyang feng8在其论文中运用了动态通量平衡分析，介绍了如何定量研究son菌如何相继应用乳酸以及其代谢物丙酮酸和乙酸。